Scratch is a simple, interactive, collaborative software development environment for creating interactive stories, animations, games, music, and graphics—and publishing them on the Internet. Scratch is designed to help children (ages 8 and up) implement 21st century educational skills. As they create Scratch projects, children learn important math and computer concepts and gain a deeper understanding of the design process.

Chemtool - 2D-редактор для рисования химических соединений под X11 (используется GTK+). Он поддерживает много стилей соединения, большую часть видов отображения текста, используемых в химии и сплайновые/дуговые/кривые стрелки.
Рисунки можно экспортировать в форматы MOL и PDB, для дальнейшего описания - в SVG или XFig, в виде рисунков PiCTeX, в растровые или Postscript файлы (для некоторых операций используется программа из XFig -- transfig).
Также пакет содержит вспомогательную программу, cht, для вычисления формул и (точного) молекулярного веса нарисованного элемента файла chemtool. Cht может вызываться прямо из Chemtool или из консоли.

KTuberling - художественная игра для маленьких детей, которая включает несколько задач. нарисовать для картофеля смешное лицо, одежду, другие доспехи, построить маленькое место, создать в нем школу, зоопарк, пожарную охрану, создать фантастический ландшафт на Луне с космическим кораблем и инопланетянами.
KTuberling называет каждый предмет на нескольких языках, что помогает улучшить словарный запас

Графический интерфейс к вычислительным химическим пакетам Gamess-US, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, PCGamess и Q-Chem. Он включает трехмерный редактор молекул и вьювер

— это рисованная игра-головоломка в духе (пожалуй, и стиле) игры Crayon Physics, в которой используется тот же отличный движок Box2D. В ней соединены забавная, как в ученической тетради, графика и весьма реалистичный физический игровой движок.
Имеется встроенный редактор, при помощи которого можно построить свои собственные уровни и поделиться ими с другими игроками

KGeography — программа, помогающая изучать географию. Вы можете использовать её, чтобы исследовать карту, просматривать различную информацию о регионах мира и устраивать викторины для проверки вашего знания географии.

Thonny is a simple Python IDE with features useful for learning programming.

It comes with a debugger which is able to visualize all the conceptual steps taken to run a Python program (executing statements, evaluating expressions, maintaining the call stack). There is a GUI for installing 3rd party packages and special mode for learning about references.

KAnagram это игра, где случайное слово отображается с буквы перемешаны.
Чтобы победить, игрок должен переставить буквы в правильном порядке

Vym (View Your Mind) is a mind diagramming program. It is useful for organizing thoughts and working on structuring something.
A connection diagram (mind map, mindmap) is a color radial diagram with an image in the center, illustrating semantic and other connections between parts of scientific material.
For example, it can graphically illustrate the structure of a dissertation plan, a project plan, or the structure of government institutions in an area.
Communication diagrams have many applications in personal, family, educational, and business situations.
Opportunities include note-taking, brainstorming, summarizing, revising, and general clarification of thoughts.

Библиотека регрессии, эконометрических и временных рядов GNU (gretl) — это пакет программного обеспечения для эконометрического анализа.

Пакет включает в себя общую библиотеку, клиентскую программу командной строки и графический клиент.