Даний продукт багато в чому є аналогом (а подекуди і набагато більш функціональний) комерційного пакету Vector NTI, однак відрізняється кроссплатформенную, підтримкою можливостей сучасного заліза (многопоточность, CUDA) і можливістю самому писати плагіни або мишеклікабельно створювати обчислювальні ланцюжки з плагінів вже існуючих.

Основні можливості:
- Множина вирівнювання послідовностей на основі MUSCLE 3 і MUSCLE 4;
- Аналіз за допомогою прихованих марківських моделей, заснований на HMMER 2 і HMMER 3;
- Дизайн ПЛР-праймерів за допомогою Primer 3;
- Передбачення вторинної структури білків за допомогою GOR IV і PSIPRED;
- Філогенетичний аналіз за допомогою Phylip;
- Пошук сайтів рестрикції;
- Супершвидкий пошук простих і тандемних повторів;
- Аналіз сайтів зв'язування транскрипційних факторів на основі SITECON;
- Пошук відкритих рамок зчитування;
- Вирівнювання послідовностей за допомогою алгоритму з мита-Ватермана.

Система комп'ютерної алгебри Maxima - має найширший набір засобів для проведення аналітичних обчислень, чисельних обчислень і побудови графіків.
По набору можливостей система близька до таких комерційних систем як Maple і Mathematica.
Це єдина з існуючих систем аналітичних обчислень, яка може працювати на всіх основних сучасних операційних системах на комп'ютерах, починаючи від найпотужніших аж до наладонних комп'ютерів.

BASIC-256 - це проста у використанні версія BASIC, призначена для навчання дітей основ програмування. Використовує традиційні команди, такі як gosub, for/next та goto, що спрощує для дітей розуміння ходу роботи програми. Має вбудований графічний режим, що дозволяє намалювати картинку на екрані за кілька хвилин, а також набір докладних та простих посібників, які пояснюють принципи програмування на кумедних прикладах.

За допомогою FlashQuard ви можете створювати картки для повторення будь-якого матеріалу. Додаток дозволяє створювати картки для різних тем, вставляти картинки, записувати відповіді, крім того, воно включає функцію "електронної озвучення".

Вона виглядає GNOME і відчувати, хороший вибір варіантів вікторини, а також підтримує UTF-8. Карти можуть включати в себе вбудовані аудіо, зображень і математичних формул (через LaTeX). Вона може імпортувати і експортувати файли деяких форматів, включаючи CSV, jMemorize і Мнемозина. Ignuit можуть бути використані як для довгострокового навчання та зубріння

Блінкен заснована на електронних іграх, випущена в 1978 році, яка кидає виклик гравцям пам'ятати послідовності збільшення довжини. На перший погляд пристрій, Є 4 кнопки різних кольорів, кожен з яких має власний відмітний звук. Ці кнопки загоряються випадково, створюючи послідовність, гравець повинен згадати. Якщо гравець успішно в запам'ятовуванні послідовності вогні в правильному порядку, вони перейти на наступний етап, де аналогічні послідовності з одним додатковим кроком буде представлена.

MathMod позволяет строить трехмерные математические поверхности, описываемые неявными или параметрическими уравнениями, и предлагает очень большую базу данных образцов моделей, которые можно сгенерировать с его помощью.
Он визуализирует и анимирует неявные и параметрические поверхности.
MathMod поддерживает:
✔ 3D и 4D черчение и анимацию
✔ текстуры и пигментацию
✔ эффекты шума и турбулентности
Имеет большой набор скриптовых примеров. Формат выходного файла OBJ.

САПР німецьких розробників, активно розвивається, можливо безкоштовне використання без обмежень.

gCAD3D може:
- імпорт і експорт-програм (STEP, IGES, VRML, DXF, SVG ..)
- інтегрований 3D-OpenGL глядача,
- програма перекладач для геометрії і NC команди в 3D,
- інтегрованих НК процесора.
- інтерфейс програмування для userprograms (плагінів)

Eclipse - в першу чергу повноцінна Java IDE, націлена на групову розробку, забезпечена засобами для роботи з системами контролю версій (підтримка CVS входить в поставку Eclipse, активно розвиваються кілька варіантів SVN-модулів, існує підтримка VSS та інших). В силу безкоштовності і високої якості в багатьох організаціях Eclipse - корпоративний стандарт для розробки додатків.
Друге призначення Eclipse - служити платформою для розробки нових розширень (чим і завоював популярність - будь-який розробник може розширити Eclipse своїми модулями). Такими стали C / C ++ Development Tools (CDT), що розробляються інженерами QNX спільно з IBM, COBOL, FORTRAN, PHP кошти від різних розробників. Безліч розширень доповнює Eclipse менеджерами для роботи з базами даних, серверами додатків і ін.
З версії 3.0 Eclipse став не монолітною підтримуючої розширення IDE, а набором розширень. В основі лежать фреймворк OSGi і SWT / JFace, на основі яких розроблено наступний шар - платформа для розробки повноцінних клієнтських додатків RCP (Rich Client Platform). Платформа RCP служить основою для RCP-додатків, таких як Azureus і File Arranger. Наступний шар - платформа Eclipse, що представляє собою набір розширень RCP - редактори, панелі, перспективи, модуль CVS і модуль Java Development Tools (JDT)

Це повністю готова система візуалізації молекул (молекулярної візуалізації) для використання в структурній біології.
Дозволяє створювати високоякісні тривимірні зображення як малих молекул, так і біологічних макромолекул, насамперед білків.
Приблизно чверть усіх зображень структур білків, що публікуються в науковій літературі, зроблено за допомогою PyMOL.