Thonny is a simple Python IDE with features useful for learning programming.

It comes with a debugger which is able to visualize all the conceptual steps taken to run a Python program (executing statements, evaluating expressions, maintaining the call stack). There is a GUI for installing 3rd party packages and special mode for learning about references.

Quantum GIS (QGIS) является географической информационной системой (ГИС) с дружественным интерфейсом и открытым исходным кодом. QGIS распространяется на условиях лицензии GNU General Public License и работает в Linux, Unix, Mac OSX и Windows.
QGIS поддерживает векторные и растровые форматы (в том числе широко распространенные ESRI Shapefile и GeoTIFF), а также пространственные базы данных. Для QGIS существует множество всевозможных плагинов, управление которыми осуществляется при помощи Менеджера плагинов

Маленькая программа, основанная на X/GTK+, позволяет просматривать периодическую таблицу химических элементов и некоторую, более детальную, информацию о каждом элементе. На данный момент доступно 118 элементов

TkGate - это управляемая событиями программа моделирования электронных схем с графическим редактором. Поддерживает широкий диапазон простейших электронных компонентов а также определенные пользователем модули для многоуровневой разработки. В поставку программы включены несколько учебников, которые могут быть загружены через меню Help и примеры схем, включая простейший процессор, запрограммированный для запуска игры Animals.

Возможности:

Chemtool - 2D-редактор для рисования химических соединений под X11 (используется GTK+). Он поддерживает много стилей соединения, большую часть видов отображения текста, используемых в химии и сплайновые/дуговые/кривые стрелки.
Рисунки можно экспортировать в форматы MOL и PDB, для дальнейшего описания - в SVG или XFig, в виде рисунков PiCTeX, в растровые или Postscript файлы (для некоторых операций используется программа из XFig -- transfig).
Также пакет содержит вспомогательную программу, cht, для вычисления формул и (точного) молекулярного веса нарисованного элемента файла chemtool. Cht может вызываться прямо из Chemtool или из консоли.

Система контроля версий Subvervion, она же SVN, чрезвычайно удобна для небольшой группы, особенно если серьёзных требований по веткам и их слиянию не предъявляется. И хотя в консоли Subversion пользоваться удобно и просто, иногда бывает удобнее просмотреть графически историю версий или быстро вытащить нужный файл определённой ревизии

KBasic - среда разработки для языка Basic, аналогичная Visual Basic.
KBasic является мощной, но в тоже время интуитивной и простой в использовании средой для программирования на языке Basic.
Среда понимает диалекты BASIC такие как VB.NET(R), Visual Basic(R), Visual Basic for Application(R) и Java(R) и имеет 100% обратную совместимость с VB6, VBA и QBasic(R).
Кроме того, имеет поддержку синтаксиса, функций и подобных объектов и классов VB.NET(R).

Light Speed! - программа, иллюстрирующая эффекты изменения внешнего вида движущихся объектов из специальной теории относительности. Когда объект ускоряется до нескольких миллионов метров в секунду, эти эффекты становятся заметными, наибольшее же их проявление достигается по мере приближения к скорости света. Эти релятивистские эффекты зависят от точки зрения наблюдателя и включают в себя сдвиги в длине, оттенке, яркости и форме объекта.

GRASS (Geographic Resources Analysis Support System) - это геоинформационная система (GIS), используемая для обработки и анализа геопространственных данных, обработки изображений, создания графики и карт, пространственного моделирования и визуализации. В настоящее время GRASS применяется в академической и коммерческой деятельности, используется многими правительственными агентствами и экологическими консалтинговыми компаниями.

Scribus is an application for professional visual layout of printed documents (newspapers, magazines, brochures, literature, etc.) capable of creating high-quality pages for any purpose - be it replication for printing or electronic distribution.
Scribus supports all the features of professional publishing systems, such as extensive capabilities for layout and pre-press preparation of text, the CMYK color model, Spot Colors, the ICC color output management system, and the creation of PDF files.
This is similar to AdobeInDesign or QuarkXPress.