Eclipse — в первую очередь полноценная Java IDE, нацеленная на групповую разработку, снабжённая средствами для работы с системами контроля версий (поддержка CVS входит в поставку Eclipse, активно развиваются несколько вариантов SVN-модулей, существует поддержка VSS и других). В силу бесплатности и высокого качества во многих организациях Eclipse — корпоративный стандарт для разработки приложений.
Второе назначение Eclipse — служить платформой для разработки новых расширений (чем и завоевал популярность — любой разработчик может расширить Eclipse своими модулями). Таковыми стали C/C++ Development Tools (CDT), разрабатываемые инженерами QNX совместно с IBM, COBOL, FORTRAN, PHP средства от различных разработчиков. Множество расширений дополняет Eclipse менеджерами для работы с базами данных, серверами приложений и др.
С версии 3.0 Eclipse стал не монолитной поддерживающей расширения IDE, а набором расширений. В основе лежат фреймворк OSGi и SWT/JFace, на основе которых разработан следующий слой — платформа для разработки полноценных клиентских приложений RCP (Rich Client Platform). Платформа RCP служит основой для RCP-приложений, таких как Azureus и File Arranger. Следующий слой — платформа Eclipse, представляющая собой набор расширений RCP — редакторы, панели, перспективы, модуль CVS и модуль Java Development Tools (JDT)

This is a fully ready-to-use molecular visualization (molecular imaging) system for use in structural biology.
It allows to create high-quality three-dimensional images of both small molecules and biological macromolecules, primarily proteins.
About a quarter of all published images of protein structures in the scientific literature are made with PyMOL.

KDE Education Project — пакет образовательных компьютерных программ. Он фокусирует своё внимание на разработке программ для детей в возрасте от 3 до 18 лет.
Кроме того в пакет входят программы для преподавателей, помогающие планировать уроки.

Программы затрагивают такие темы как:
Языки, Математика, Наука, Инструменты учителя и другие

FlameRobin is a GUI tool for administering the Firebird database management system
Her goals:
- undemanding to resources (low memory consumption, fast operation)
- cross-platform (Linux, Windows for starters, support for other systems is planned)
- dependence only on other free software

ParaView — программа для параллельной интерактивной научной визуализации, имеет клиент-серверную архитектуру для облегчения удалённой визуализации баз данных и генерирования моделей уровней детализации (level of detail — LOD). Стоит отметить, что данная программа основана на библиотеке VTK (Visualization Toolkit), которая предоставляет визуализационные сервисы для различных видов параллельной обработки данных, поэтому ParaView может быть запущена на кластерах и компьютерах с общей или распределённой памятью.

Glade - RAD-утилита, предоставляющая возможность быстрой и легкой разработки пользовательских интерфейсов на основе библиотеки GTK+ и GTK+ 2
Пользовательские интерфейсы, сконструированные в Glade, сохраняются в широко распространённом формате XML, позволяющем легко взаимодействовать с внешними утилитами. Вам стоит обратить внимание на библиотеку libglade, которая может загружать XML-файлы и создавать интерфейсы во время работы программы.
Пакет включает модуль, позволяющий Glade создавать GNOME виджеты в использованием его палитры.

Veusz is a 2D and 3D scientific plotting and graphing package, designed to produce publication-ready PDF, SVG, Postscript and bitmap output.
Veusz provides a GUI, command line and scripting interface (based on Python) to its plotting facilities.
The plots are built using an object-based system to provide a consistent interface.

DraftSight является бесплатной 2D САПР (системы автоматизированного проектирования и автоматизированной разработки) продукт для инженеров, архитекторов, дизайнеров, студентов и преподавателей.

Продукт позволяет создавать, редактировать и просматривать DWG и DXF файлы. DWG-файлы содержат двоичные данные для проектирования CAD и этот формат используется многими программами САПР.

DWG является стандартом де-факто в современном проектировании. DXF формат файла используется для преобразования CAD файлов в универсальный формат, который можно прочитать в других программах САПР.

содержит гораздо больше информации о периодической системе Менделеева, чем любой студент университета когда-либо хотел бы узнать. Приложение также решает химические уравнения, показывает изображения элементов и содержит полезный словарь терминов

Эта программа представляет собой реализацию оригинальных счетов, она предоставляет китайскую, японскую, корейскую, римскую и русскую версии и может быть изменена для использования другими.