Octave - язык высокого уровня предназначенный для выполнения вычислений численными методами и математических вычислений.
Он представляет собой удобный командный интерфейс для решения линейных и нелинейных математических задач, а также проведения других арифметических экспериментов, используя язык, в большинстве случаев совместимый с Matlab

Цель QDevelop состоит в том, чтобы обеспечивать кросс-платформенное программирование в наиболее используемых средах, в GNU/Linux, Windows NT и Mac OS X используя один и тот же IDE.
В особенности QDevelop входит поддержка Qt-Designer для создания графического интерфейса, что превращает связку из QDevelop и Qt-Designer в среду визуальной разработки и тем самым соответствует концепту быстрой разработки приложений (RAD). Также поддерживается Qt-Linguist для осуществления интернационализации.

SQLiteman — инструмент администрирования баз данных sqlite3 в графическом интерфейсе очень прост в использовании.

Chemtool - 2D-редактор для рисования химических соединений под X11 (используется GTK+). Он поддерживает много стилей соединения, большую часть видов отображения текста, используемых в химии и сплайновые/дуговые/кривые стрелки.
Рисунки можно экспортировать в форматы MOL и PDB, для дальнейшего описания - в SVG или XFig, в виде рисунков PiCTeX, в растровые или Postscript файлы (для некоторых операций используется программа из XFig -- transfig).
Также пакет содержит вспомогательную программу, cht, для вычисления формул и (точного) молекулярного веса нарисованного элемента файла chemtool. Cht может вызываться прямо из Chemtool или из консоли.

Пакет прикладных математических программ, предоставляющий мощное открытое окружение для инженерных (технических) и научных расчётов.
Scilab содержит сотни математических функций, и есть возможность добавления новых, написанных на различных языках (C, C++, Fortran …). Так же имеются разнообразные структуры данных (списки, полиномы, рациональные функции, линейные системы), интерпретатор и язык высокого уровня.
Scilab был спроектирован как открытая система, и пользователи могут добавлять в него свои типы данных и операции путём перегрузки.

В системе доступно множество инструментов:

Проект gEDA - набор инструментов системы автоматизированного проектирования электроники. Эти инструменты используются для проектирования электронных устройств, создания схемотехники, симуляции, создания прототипов и производства.

Проект gEDA предлагает сложившийся инструментарий проектирования электронных устройств, состоящий из программ для создания схемотехники, редактирования атрибутов, создания списка элементов, списка соединений (в более чем 20-ти форматах), аналоговой и цифровой симуляции и топологии печатной платы

KLettres помогает научиться читать и произностить алфавит иностранного языка.

На данный момент доступно 25 языков: Arabic, Czech, Brazilian Portuguese, Danish, Dutch, British English, English, English Phonix, French, German, Hebrew, Hungarian, Italian, Kannada, Hebrew, Hindi Romanized, Low Saxon, Luganda, Malayalam, Norwegian Bokmål, Punjabi, Spanish, Slovak, Ukrainian and Telugu

Компьютерная программа, предназначенная для визуализации молекул и используемая преимущественно для изучения и получения изображений пространственных структур биологических макромолекул, в первую очередь белков и нуклеиновых кислот.
Начиная с версий серии 2.7, RasMol распространяется по двойной лицензии (GPL или RASLIC). Тем самым, RasMol (наряду с Jmol и PyMOL) — одна из немногих программ визуализации молекул с открытым кодом.
RasMol остаётся лучшей из учебных программ визуализации молекул; кроме того, несмотря на наличие более сложных аналогов, продолжает активно использоваться молекулярными биологами и биоинформатиками. Благодаря простой и логичной структуре пользовательского интерфейса, программа проста для освоения. Система команд ("язык" RasMol'а) используется в других программах, например, в Jmol.
Исходными данными для визуализации служат координаты атомов молекулы (или комплекса молекул), содержащиеся в файле формата Protein Data Bank (PDB). Файлы с координатами атомов могут быть скопированы с одного из сайтов PDB

FreeCAD is an extensible CAD/CAM system that includes some key concepts such as macro recording, workspaces, the ability to run as a server, and dynamically loaded application extensions.

FreeCAD can import and display CAD models in IGES, STEP and BRep formats, as well as meshes in STL, BMS, AST and Wavefront OBJ formats.

Code::Blocks is a cross-platform Integrated Development Environment (IDE). It is based on a self-developed plugin framework allowing unlimited extensibility. Most of its functionality is already provided by plugins. Plugins included in the base package are:
* Compiler frontend to many free compilers
* Debugger frontend for GDB
* Source formatter (based on AStyle)
* Wizard to create new C++ classes
* Code-completion / symbols-browser (work in progress)
* Default MIME handler
* Wizard to create new Code::Blocks plugins
* To-do list
* Extensible wizard based on scripts
* Autosave (saves your work in the unfortunate case of a crash)