Данный продукт во многом является аналогом (а местами и гораздо более функционален) коммерческого пакета Vector NTI, однако отличается кроссплатформенностью, поддержкой возможностей современного железа (многопоточность, CUDA) и возможностью самому писать плагины либо мышекликабельно создавать вычислительные цепочки из плагинов уже существующих.

Основные возможности:
- Множественное выравнивание последовательностей на основе MUSCLE 3 и MUSCLE 4;
- Анализ с помощью скрытых марковских моделей, основанный на HMMER 2 и HMMER 3;
- Дизайн ПЦР-праймеров с помощью Primer 3;
- Предсказание вторичной структуры белков с помощью GOR IV и PSIPRED;
- Филогенетический анализ с помощью Phylip;
- Поиск сайтов рестрикции;
- Сверхбыстрый поиск простых и тандемных повторов;
- Анализ сайтов связывания транскрипционных факторов на основе SITECON;
- Поиск открытых рамок считывания;
- Выравнивание последовательностей с помощью алгоритма Смита-Ватермана

Эйлер является мощным численные лаборатории с языком программирования. Система может работать с вещественными, комплексными и интервальных чисел, векторов и матриц. Он может производить 2D/3D участков.

Эйлер функций среди прочего:
* Действительных, комплексных и интервал скаляров и матриц
* Язык программирования, с локальными переменными, значения по умолчанию для параметров, переменное число параметров, передав функции
* Двух-и трехмерном графы
* Участки маркера
* Плотность и контурные графики
* анимация
* Численного интегрирования и дифференцирования
* Статистические функции и тесты
* Дифференциальных уравнений
* Интервальных методов с гарантированным включений
* Функция минимизаторов (Brent, Нелдера-Среднее)
* Симплексный алгоритм
* Интерполяции и аппроксимации
* Нахождение корней многочленов
* Быстрое преобразование Фурье (БПФ)
* Точное скалярного произведения с помощью длинной аккумулятором
* PostScript-графики экспорта

Oregano - представляет собой приложение для схематического захвата и моделирования электронных схем.
Он может открывать и редактировать схемы, которые созданы с использованием Gnucap, NG-Spice или Berkeley spice

Eclipse — в первую очередь полноценная Java IDE, нацеленная на групповую разработку, снабжённая средствами для работы с системами контроля версий (поддержка CVS входит в поставку Eclipse, активно развиваются несколько вариантов SVN-модулей, существует поддержка VSS и других). В силу бесплатности и высокого качества во многих организациях Eclipse — корпоративный стандарт для разработки приложений.
Второе назначение Eclipse — служить платформой для разработки новых расширений (чем и завоевал популярность — любой разработчик может расширить Eclipse своими модулями). Таковыми стали C/C++ Development Tools (CDT), разрабатываемые инженерами QNX совместно с IBM, COBOL, FORTRAN, PHP средства от различных разработчиков. Множество расширений дополняет Eclipse менеджерами для работы с базами данных, серверами приложений и др.
С версии 3.0 Eclipse стал не монолитной поддерживающей расширения IDE, а набором расширений. В основе лежат фреймворк OSGi и SWT/JFace, на основе которых разработан следующий слой — платформа для разработки полноценных клиентских приложений RCP (Rich Client Platform). Платформа RCP служит основой для RCP-приложений, таких как Azureus и File Arranger. Следующий слой — платформа Eclipse, представляющая собой набор расширений RCP — редакторы, панели, перспективы, модуль CVS и модуль Java Development Tools (JDT)

Celestia позволяет вам увидеть ночное небо с Земли, но также даёт вам пролететь сквозь трёхмерную модель космоса в любое изученное место Вселенной. По возможности программа использует актуальные фотографии планет, астероидов и других объектов, так что вы можете увидеть, как они выглядят в действительности
Celestia -- трёхмерная астрономическая программа, основанная на каталоге звёзд Hipparcos. Она позволяет пользователям видеть объекты различных размеров, начиная от искусственных спутников до целых галактик в трёх измерениях, используя OpenGL. В отличие от большинства программ для планетария, пользователь может беспрепятственно путешествовать по всей Вселенной.

Quantum GIS (QGIS) является географической информационной системой (ГИС) с дружественным интерфейсом и открытым исходным кодом. QGIS распространяется на условиях лицензии GNU General Public License и работает в Linux, Unix, Mac OSX и Windows.
QGIS поддерживает векторные и растровые форматы (в том числе широко распространенные ESRI Shapefile и GeoTIFF), а также пространственные базы данных. Для QGIS существует множество всевозможных плагинов, управление которыми осуществляется при помощи Менеджера плагинов

IDLE is an Integrated Development Environment for Python.
IDLE is written using Tkinter and is therefore available on different operating systems.

использует 3D графику и предлагает различные типы шахматных досок, начиная от классической деревянной до плоской.
Включен умеренно сильный шахматный движок: Dreamer. Тем не менее, если этот движок слабый для вас, вы можете использовать любой XBoard- совместимый шахматный движок, включая популярный Crafty и GNU Chess. Другие возможности: список шагов на экране, использующий SAN записи, возможность отмены шагов и сохранение игры в формат PGN

BricsCAD предлагает полный набор функций для профессиональных пользователей, имеет интуитивно понятный интерфейс и не требует дополнительного обучения. Он использует формат DWG и обеспечивает полную совместимость с AutoCAD®.

Ключевыми составляющими успеха является сочетание DWG совместимости, понятного интерфейса. Это делает Bricscad™ лучшей альтернативой для замены лицензий AutoCAD или добавления большого количества рабочих мест в существующую среду AutoCAD.

The Mars Simulation Project is a project aimed at simulating future human settlements on Mars.
The primary goal of this software is to enable the simulation of future human settlements on Mars, including social modeling (simulating the behavior of scientists, engineers, doctors, technicians, etc.) in a virtual Martian environment.