Данный продукт во многом является аналогом (а местами и гораздо более функционален) коммерческого пакета Vector NTI, однако отличается кроссплатформенностью, поддержкой возможностей современного железа (многопоточность, CUDA) и возможностью самому писать плагины либо мышекликабельно создавать вычислительные цепочки из плагинов уже существующих.

Основные возможности:
- Множественное выравнивание последовательностей на основе MUSCLE 3 и MUSCLE 4;
- Анализ с помощью скрытых марковских моделей, основанный на HMMER 2 и HMMER 3;
- Дизайн ПЦР-праймеров с помощью Primer 3;
- Предсказание вторичной структуры белков с помощью GOR IV и PSIPRED;
- Филогенетический анализ с помощью Phylip;
- Поиск сайтов рестрикции;
- Сверхбыстрый поиск простых и тандемных повторов;
- Анализ сайтов связывания транскрипционных факторов на основе SITECON;
- Поиск открытых рамок считывания;
- Выравнивание последовательностей с помощью алгоритма Смита-Ватермана

Программа для нелинейной аппроксимации и анализа функций. Позволяет проводить визуализацию данных, а основное ее назначение — разделение перекрывающихся пиков, и подбор параметров методом наименьших квадратов с использованием стандартного алгоритма Левенберга-Марквардта, обычного алгоритма или симлексного метода Нелдера-Мида.
По умолчанию в программе имеются встроенные общие «колоколообразные» (bell-shaped) функции (Gaussian, Loretzian, Pearson 7, Voigt, Pseudo-Voigt) и полиномы. Любые же пользовательские функции могут быть легко добавлены. Поддерживается также фоновую замену переменных, калибровку данных и автоматизацию заданий с помощью простого скриптового языка программирования

KAlgebra является алгебраической графический калькулятор с поддержкой 3D-графики и MathML языка разметки

Colobot (Colonize with Bots) is a game aimed at teaching programming through fun. You play the role of an astronaut traveling with robot assistants in search of a planet to colonize.
The game features real-time 3D graphics and the C++ and Java-like object-oriented language CBOT, which can be used to program the robots available in the game.

Очень полезно для тех, кто только начинает изучать HTML+CSS. Ну, и как систематизированная шпаргалка WDT тоже пригодится в хозяйстве.
В данный комплекс, кроме всего прочего, входит своя реализация ToDo-листа, благодаря которому можно планировать своё время, ставить задачи, оставлять заметки и т.п. Менеджер задач хоть и простой, но, в рамках данной программы, вполне достаточный.
При создании блоков при помощи стилей, наглядно видно вносимые изменения и получаем готовый код CSS.
Позволяет отображать результат в разных версиях браузеров.
Так же, имеется WYSIWYG-редактор, встроенный браузер на Webkit, анализатор и валидатор HTML и CSS.
Web Developer Tools - speed up позволит легко определить "узкое место" в скорости отображения вашей веб-страницы.

BRL-CAD is a powerful cross-platform Open Source combinatorial Constructive Solid Geometry (CSG) solid modeling system that includes interactive 3D solid geometry editing, high-performance ray-tracing support for rendering and geometric analysis, network-distributed framebuffer support, image and signal-processing tools, path-tracing and photon mapping support for realistic image synthesis, a system performance analysis benchmark suite, an embedded scripting interface, and libraries for robust high-performance geometric representation and analysis.

Little Wizard был создан специально для детей школьного возраста. Программа обучает основным элементам существующих компьютерных языков, в том числе: переменные, выражения, циклы, условия, логические блоки. Каждый элемент языка представлен в виде понятного значка. В программе Little Wizard можно не использовать клавиатуру, только мышь

Инструмент программирования, необходимый для замены прошивки на аппаратный USBprog. Он может автоматически получать список доступных прошивок из Интернета, скачивать одну из них и загружать ее на адаптер USBprog. USBprog является адаптером свободного программирования. Вы с легкостью можете устанавливать различные версии прошивок от "онлайн пул" по USB. Адаптер может быть использован для программирования и отладки AVR-и ARM-процессоров, как USB-RS232 конвертер, JTAG-интерфейс или как простой интерфейс ввода/вывода (5 линий)

IDLE is an Integrated Development Environment for Python.
IDLE is written using Tkinter and is therefore available on different operating systems.

Fritzing — это аппаратная инициатива, которая делает электронику доступной как творческий материал для каждого. Программный инструмент в духе Processing и Arduino позволяет документировать свои прототипы, делиться ими с другими, преподавать электронику в классе, а также компоновать и производить профессиональные печатные платы.