GeoGebra — свободно-распространяемая (GPL) динамическая геометрическая среда, которая даёт возможность создавать чертежи в планиметрии, в частности, для построений с помощью циркуля и линейки.
Кроме того, у программы богатые возможности работы с функциями (построение графиков, вычисление корней, экстремумов, интегралов и т.д.) за счёт команд встроенного языка (который, кстати, позволяет управлять и геометрическими построениями).
Программа написана Маркусом Хохенвартером на языке Java (соответственно кроссплатформенная, то есть работает на большом числе операционных систем, где есть виртуальная машина java). Переведена на 39 языков. Полностью поддерживает русский язык

KLettres помогает научиться читать и произностить алфавит иностранного языка.

На данный момент доступно 25 языков: Arabic, Czech, Brazilian Portuguese, Danish, Dutch, British English, English, English Phonix, French, German, Hebrew, Hungarian, Italian, Kannada, Hebrew, Hindi Romanized, Low Saxon, Luganda, Malayalam, Norwegian Bokmål, Punjabi, Spanish, Slovak, Ukrainian and Telugu

This is a fully ready-to-use molecular visualization (molecular imaging) system for use in structural biology.
It allows to create high-quality three-dimensional images of both small molecules and biological macromolecules, primarily proteins.
About a quarter of all published images of protein structures in the scientific literature are made with PyMOL.

С помощью Childsplay дети в режиме игры научатся распознавать звуки, изображения, буквы и числа. Дети освоятся с мышкой и клавиатурой, или просто увлекутся такими играми, как головоломки, понг, pacman (колобок в лабиринте), бильярд.

Colobot (Colonize with Bots) is a game aimed at teaching programming through fun. You play the role of an astronaut traveling with robot assistants in search of a planet to colonize.
The game features real-time 3D graphics and the C++ and Java-like object-oriented language CBOT, which can be used to program the robots available in the game.

— это рисованная игра-головоломка в духе (пожалуй, и стиле) игры Crayon Physics, в которой используется тот же отличный движок Box2D. В ней соединены забавная, как в ученической тетради, графика и весьма реалистичный физический игровой движок.
Имеется встроенный редактор, при помощи которого можно построить свои собственные уровни и поделиться ими с другими игроками

MathMod позволяет строить трехмерные математические поверхности, описываемые неявными или параметрическими уравнениями, и предлагает очень большую базу данных образцов моделей, которые можно сгенерировать с его помощью.
Он визуализирует и анимирует неявные и параметрические поверхности.
MathMod поддерживает:
✔ 3D и 4D черчение и анимацию
✔ текстуры и пигментацию
✔ эффекты шума и турбулентности
Имеет большой набор скриптовых примеров. Формат выходного файла OBJ.

KWordQuiz является общей программой флэш цели, обычно используемый для словаря обучения. KWordQuiz может открыть словарь данных в различных форматах, в том числе kvtml формат, используемый в KDE программ, таких как Парли, WQL формат, используемый WordQuiz для Windows, xml.gz формат, используемый Паукер, и CSV текст

Программа для создания двумерных рисунков молекул. Она похожа по функциональности на другие графические программы, например, ChemDraw.
Она может читать и писать разные форматы текстовых и бинарных файлов, чтобы позволяет обмениваться информацией между XDrawChem и другими программными приложениями, а также может создавать изображения в популярных графических форматах, таких как PNG и EPS

Свободная среда разработки, предназначенная для создания приложений C#, Java, Boo, Nemerle, Visual Basic .NET, CIL, C и C++.
Изначально это был порт SharpDevelop на Mono/GTK+, но с того времени проект далеко ушел от своего начального состояния.
MonoDevelop является частью проекта Mono