Данный продукт во многом является аналогом (а местами и гораздо более функционален) коммерческого пакета Vector NTI, однако отличается кроссплатформенностью, поддержкой возможностей современного железа (многопоточность, CUDA) и возможностью самому писать плагины либо мышекликабельно создавать вычислительные цепочки из плагинов уже существующих.

Основные возможности:
- Множественное выравнивание последовательностей на основе MUSCLE 3 и MUSCLE 4;
- Анализ с помощью скрытых марковских моделей, основанный на HMMER 2 и HMMER 3;
- Дизайн ПЦР-праймеров с помощью Primer 3;
- Предсказание вторичной структуры белков с помощью GOR IV и PSIPRED;
- Филогенетический анализ с помощью Phylip;
- Поиск сайтов рестрикции;
- Сверхбыстрый поиск простых и тандемных повторов;
- Анализ сайтов связывания транскрипционных факторов на основе SITECON;
- Поиск открытых рамок считывания;
- Выравнивание последовательностей с помощью алгоритма Смита-Ватермана

Cреда разработки с упором на продуктивность разработчика. IntelliJ IDEA глубоко анализирует код и предоставляет набор мощных утилит без навязывания определённого рабочего пространства или структуры проекта.
IntelliJ IDEA - это ваш идеальный напарник-программист, разбирающийся в коде и дающий удачные предложения тогда, когда вы в этом нуждаетесь, и всегда готовый помочь вам обработать код

BRL-CAD is a powerful cross-platform Open Source combinatorial Constructive Solid Geometry (CSG) solid modeling system that includes interactive 3D solid geometry editing, high-performance ray-tracing support for rendering and geometric analysis, network-distributed framebuffer support, image and signal-processing tools, path-tracing and photon mapping support for realistic image synthesis, a system performance analysis benchmark suite, an embedded scripting interface, and libraries for robust high-performance geometric representation and analysis.

Графический пользовательский интерфейс для шахмат во всех его основных форм, в том числе международных шахмат, Xiangqi (китайские шахматы) и Сеги (японские шахматы), в дополнение ко многим несовершеннолетним такие варианты, как и негативных шахматы, Крейзихаус, Chess960 и Capabanca шахматы. Она отображает шахматную доску на экране, принимает сделанных ходов с помощью мыши, и нагрузок, и сохраняет в портативных игр Game Notation (PGN)

САПР немецких разработчиков, активно развивается, возможно бесплатное использование без ограничений.

gCAD3D может:
- импорт и экспорт-программ (STEP, IGES, VRML, DXF, SVG ..)
- интегрированный 3D-OpenGL зрителя,
- Программа переводчик для геометрии и NC команды в 3D,
- интегрированных НК процессора.
- интерфейс программирования для userprograms (плагинов)

Colobot (Colonize with Bots) is a game aimed at teaching programming through fun. You play the role of an astronaut traveling with robot assistants in search of a planet to colonize.
The game features real-time 3D graphics and the C++ and Java-like object-oriented language CBOT, which can be used to program the robots available in the game.

Приложение, которое позволяет использовать математические приложения Sage, Maxima, KAlgebra с единым интегрированным интерфейсом.
Оно предлагает диалоги помощи для выполнения общих задач и позволяет делиться своими результатами работы с другими.

Основные функции:
✔Создание таблиц для вычисления выражений;
✔Открытие результатом вычислений в отдельном окне или вкладке;
✔Наличие плагинов для подключения различных библиотек;
✔Ввод формул с использованием LaTeX;
✔Подсветка синтаксиса.

KediCAD is a 2D analogue of AutoCAD.

This program has a simulation feature that allows you to make expected changes to general drawings.

KediCAD can also be used to create a drawing of the moment of inertial calculations and calculation of bends.

.

Integrated application development environment (IDE) in the programming languages Java, JavaFX, Ruby, Python, C++, PHP, JavaScript/HTML5, Groovy and several others. To support development for mobile platforms (J2ME), you must install the NetBeans Mobility Pack separately.

In terms of quality and capabilities, NetBeans IDE is not inferior to the best commercial (paid) integrated development environments, supporting refactoring, profiling, highlighting syntactic structures with color, autocompletion of typed structures on the fly, many predefined code templates, and more.

Вы можете использовать его для создания практически всех UML-диаграмм. BOUML может генерировать код и в C++, Java, Idl, Php, Python и MySQL, а также может коренным образом изменить существующие коды.
Программа поддерживает диаграммы классов, диаграммы последовательности, диаграммы кооперации, диаграммы объектов, диаграммы прецедентов, диаграммы компонентов, диаграммы состояний, диаграммы деятельности, диаграммы компонент и схем развертывания.