Есть возможность создать свою физическую модель, приложить различные силы и запульнуть какой-нибудь кубик далеко и надолго

Программа для нелинейной аппроксимации и анализа функций. Позволяет проводить визуализацию данных, а основное ее назначение — разделение перекрывающихся пиков, и подбор параметров методом наименьших квадратов с использованием стандартного алгоритма Левенберга-Марквардта, обычного алгоритма или симлексного метода Нелдера-Мида.
По умолчанию в программе имеются встроенные общие «колоколообразные» (bell-shaped) функции (Gaussian, Loretzian, Pearson 7, Voigt, Pseudo-Voigt) и полиномы. Любые же пользовательские функции могут быть легко добавлены. Поддерживается также фоновую замену переменных, калибровку данных и автоматизацию заданий с помощью простого скриптового языка программирования

Система компьютерной алгебры Maxima - имеет широчайший набор средств для проведения аналитических вычислений, численных вычислений и построения графиков.
По набору возможностей система близка к таким коммерческим системам как Maple и Mathematica.
Это единственная из существующих систем аналитических вычислений, которая может работать на всех основных современных операционных системах на компьютерах, начиная от самых мощных вплоть до наладонных компьютеров

позволяет в интерактивном режиме создавать геометрические конструкции, подобно тому, что вы можете сделать с линейкой и компасом. Очки могут быть вставлены на странице с правой кнопкой мыши щелчка, а затем используются для формирования сегментов, линий, окружностей или других геометрических объектов.
В любой момент вы можете перетащить существующих точек вокруг, и смотреть, как построенные объекты ответить

An object-oriented dialect of the BASIC language, complemented by an integrated development environment and running on GNU/Linux and other UNIX-like operating systems.

It is a tool similar to Visual Basic in terms of developing Basic programs.

Gambas was conceived as an alternative for Microsoft Visual Basic developers who decided to switch to GNU/Linux

Известная игра в виселицу. Пользователь должен отгадать слово буква за буквой.
Ему даётся 10 попыток, каждая неудачная попытка пририсовывает деталь изображения виселицы.
Программа доступна на 24 языках.

Программа для запоминания иностранных слов.

Список её преимуществ перед аналогами:
- Широкие возможности по настройке вида карточек;
- Поддержка мультимедиа;
- Большое количество плагинов;
- Настройка алгоритма обучения;
- Подробная статистика;
- Поддержка большинства современных платформ (Linux, Windows, Mac, iPhone, Android и др.);
- Синхронизация данных

С помощью Childsplay дети в режиме игры научатся распознавать звуки, изображения, буквы и числа. Дети освоятся с мышкой и клавиатурой, или просто увлекутся такими играми, как головоломки, понг, pacman (колобок в лабиринте), бильярд.

SimulIDE is a simple electronic circuit simulator. It allows you to interactively simulate analog and digital circuits, as well as work with microcontrollers. It includes a variety of ready-made components and a built-in code editor.

It supports PIC, AVR, Arduino, and other microcontrollers and microprocessors.

Features:

Данный продукт во многом является аналогом (а местами и гораздо более функционален) коммерческого пакета Vector NTI, однако отличается кроссплатформенностью, поддержкой возможностей современного железа (многопоточность, CUDA) и возможностью самому писать плагины либо мышекликабельно создавать вычислительные цепочки из плагинов уже существующих.

Основные возможности:
- Множественное выравнивание последовательностей на основе MUSCLE 3 и MUSCLE 4;
- Анализ с помощью скрытых марковских моделей, основанный на HMMER 2 и HMMER 3;
- Дизайн ПЦР-праймеров с помощью Primer 3;
- Предсказание вторичной структуры белков с помощью GOR IV и PSIPRED;
- Филогенетический анализ с помощью Phylip;
- Поиск сайтов рестрикции;
- Сверхбыстрый поиск простых и тандемных повторов;
- Анализ сайтов связывания транскрипционных факторов на основе SITECON;
- Поиск открытых рамок считывания;
- Выравнивание последовательностей с помощью алгоритма Смита-Ватермана