Qt Creator — это новая, легкая, кросс-платформенная интегрированная среда разработки программного обеспечения (IDE), предназначенная для ускорения и упрощения разработки программ, основанных на библиотеке Qt.
Включает в себя:
✔мощный редактор кода C++
✔интегрированный дизайнер элементов GUI и форм
✔средства управления проектом и сборкой
✔интегрированная контекстно-зависимая справочная система
✔визуальный отладчик
✔инструменты быстрой навигации по коду

Данный продукт во многом является аналогом (а местами и гораздо более функционален) коммерческого пакета Vector NTI, однако отличается кроссплатформенностью, поддержкой возможностей современного железа (многопоточность, CUDA) и возможностью самому писать плагины либо мышекликабельно создавать вычислительные цепочки из плагинов уже существующих.

Основные возможности:
- Множественное выравнивание последовательностей на основе MUSCLE 3 и MUSCLE 4;
- Анализ с помощью скрытых марковских моделей, основанный на HMMER 2 и HMMER 3;
- Дизайн ПЦР-праймеров с помощью Primer 3;
- Предсказание вторичной структуры белков с помощью GOR IV и PSIPRED;
- Филогенетический анализ с помощью Phylip;
- Поиск сайтов рестрикции;
- Сверхбыстрый поиск простых и тандемных повторов;
- Анализ сайтов связывания транскрипционных факторов на основе SITECON;
- Поиск открытых рамок считывания;
- Выравнивание последовательностей с помощью алгоритма Смита-Ватермана

Chemtool - 2D-редактор для рисования химических соединений под X11 (используется GTK+). Он поддерживает много стилей соединения, большую часть видов отображения текста, используемых в химии и сплайновые/дуговые/кривые стрелки.
Рисунки можно экспортировать в форматы MOL и PDB, для дальнейшего описания - в SVG или XFig, в виде рисунков PiCTeX, в растровые или Postscript файлы (для некоторых операций используется программа из XFig -- transfig).
Также пакет содержит вспомогательную программу, cht, для вычисления формул и (точного) молекулярного веса нарисованного элемента файла chemtool. Cht может вызываться прямо из Chemtool или из консоли.

Программное обеспечение основано на debhelper, dpkg-buildpackage и других хорошо испытанных инструментах. Вы можете попробовать собрать простой пакет из архива с некоторых GNU-пакетов программного обеспечения, содержащего меньшие Makefile и конфигурационные скрипты. В будущем дополнении сможет выполнять еще больше функций.
Обратите внимание: вам не нужны особые знания структуры пакетов для использования этого приложения.

Viking создан быть простым в использовании, но достаточно мощным для решения широкого спектра задач связанных с GPS. Он использует иерархическую систему слоев для организации данных GPS, карт и других типов слоев с пространственными данными, такими как координатные линии.

Oregano - представляет собой приложение для схематического захвата и моделирования электронных схем.
Он может открывать и редактировать схемы, которые созданы с использованием Gnucap, NG-Spice или Berkeley spice

помощь для обучения, как для вычисления с дробями

KuMir (Set of Educational WORLDS) is a programming system designed to support initial computer science and programming courses in secondary and high schools.
Peculiarities:
✔ The KuMir system uses a school algorithmic language with Russian vocabulary and built-in executors Robot and Draftsman;
✔ When entering a program, KuMir carries out constant full control of its correctness, reporting in the fields of the program about all detected errors;
✔ When executing a program in step-by-step mode, KuMir displays the results of assignment operations and the values of logical expressions in the fields. This allows you to speed up the process of mastering the basics of programming.

Quantum GIS (QGIS) является географической информационной системой (ГИС) с дружественным интерфейсом и открытым исходным кодом. QGIS распространяется на условиях лицензии GNU General Public License и работает в Linux, Unix, Mac OSX и Windows.
QGIS поддерживает векторные и растровые форматы (в том числе широко распространенные ESRI Shapefile и GeoTIFF), а также пространственные базы данных. Для QGIS существует множество всевозможных плагинов, управление которыми осуществляется при помощи Менеджера плагинов

Пакет прикладных математических программ, предоставляющий мощное открытое окружение для инженерных (технических) и научных расчётов.
Scilab содержит сотни математических функций, и есть возможность добавления новых, написанных на различных языках (C, C++, Fortran …). Так же имеются разнообразные структуры данных (списки, полиномы, рациональные функции, линейные системы), интерпретатор и язык высокого уровня.
Scilab был спроектирован как открытая система, и пользователи могут добавлять в него свои типы данных и операции путём перегрузки.

В системе доступно множество инструментов: