Система комп'ютерної алгебри Maxima - має найширший набір засобів для проведення аналітичних обчислень, чисельних обчислень і побудови графіків.
По набору можливостей система близька до таких комерційних систем як Maple і Mathematica.
Це єдина з існуючих систем аналітичних обчислень, яка може працювати на всіх основних сучасних операційних системах на комп'ютерах, починаючи від найпотужніших аж до наладонних комп'ютерів.

За допомогою FlashQuard ви можете створювати картки для повторення будь-якого матеріалу. Додаток дозволяє створювати картки для різних тем, вставляти картинки, записувати відповіді, крім того, воно включає функцію "електронної озвучення".

Система контролю версій Subvervion, вона ж SVN, надзвичайно зручна для невеликої групи, особливо якщо серйозних вимог по гілках і їх злиття не пред'являється. І хоча в консолі Subversion користуватися зручно і просто, іноді буває зручніше переглянути графічно історію версій або швидко витягти потрібний файл певної ревізії.

Veusz – це пакет для створення 2D та 3D наукових графіків, призначений для створення готових до публікації PDF, SVG, Postscript та растрових зображень.
Veusz надає графічний інтерфейс, командний рядок та інтерфейс сценаріїв (на основі Python) для своїх засобів побудови графіків.
Графіки будуються з використанням об'єктно-орієнтованої системи, що забезпечує одноманітний інтерфейс.

Bluefish – потужний редактор, призначений для програмістів та web-розробників. Він має безліч опцій для створення веб-сайтів, сценаріїв та коду програм. Bluefish підтримує різні мови програмування, мови розмітки та має безліч особливостей, серед яких:
- Настроюване згортання коду, автоматичні відступи та завершення.
- Підтримка віддаленої роботи з файлами через FTP, SFTP, HTTPS, WebDAV і т.д.
- Завантаження та скачування сайту.
- Потужний механізм пошуку та заміни
- Плагін Snippets для автоматизації коду, що часто використовується.
- Підтримка Zencoding або Emmet

— це мальована гра-головоломка в дусі (мабуть, і стилі) гри Crayon Physics, в якій використовується той же відмінний двигун Box2D. У ній поєднуються кумедна, як в учнівському зошиті, графіка і вельми реалістичний фізичний ігровий движок.
Є вбудований редактор, за допомогою якого можна побудувати свій власний рівень і поділитися ними з іншими гравцями.

Эта программа представляет собой реализацию оригинальных счетов, она предоставляет китайскую, японскую, корейскую, римскую и русскую версии и может быть изменена для использования другими.

QtiPlot - програмне забезпечення для аналізу і візуалізації наукових даних.
QtiPlot по функціональності схожий на Origin і SigmaPlot, і використовується для їх заміни в інститутах. QtiPlot може використовуватися для створення 2D і 3D графіків і містить велику кількість функцій для аналізу даних, таких як апроксимація кривих і т.п.
При побудові 3D-графіків рендеринг може проводитися з використанням OpenGL за допомогою бібліотеки Qwt3D.

Chemtool - 2D-редактор для малювання хімічних сполук під X11 (використовується GTK +). Він підтримує багато стилів з'єднання, більшу частину видів відображення тексту, що використовуються в хімії і сплайнові / дугові / криві стрілки.
Малюнки можна експортувати у формати MOL і PDB, для подальшого опису - в SVG або XFig, у вигляді малюнків PiCTeX, в растрові або Postscript файли (для деяких операцій використовується програма з XFig - transfig).
Також пакет містить допоміжну програму, cht, для обчислення формул і (точного) молекулярної ваги намальованого елемента файлу chemtool. Cht може викликатися прямо з Chemtool або з консолі.

Библиотека регрессии, эконометрических и временных рядов GNU (gretl) — это пакет программного обеспечения для эконометрического анализа.

Пакет включает в себя общую библиотеку, клиентскую программу командной строки и графический клиент.