Інтегроване середовище розробки мови Python. У нього включений графічний налагоджувач, який підтримує інтерактивне дослідження під час зупинення та авто-зупинки на критичних винятках.
Основні можливості:
- Менеджер проектів;
- редактор з підсвічуванням синтаксису;
- Дебаггер, профайлер;
- запуск пітонівського коду з підтримкою параметрів командного рядка;
- юніт-тестування;
- Консоль для виведення та менеджер завдань (самовідновлюваний TODO-лист).

GeoGebra - вільно-розповсюджувана (GPL) динамічна геометрична середовище, яке дає можливість створювати креслення в планіметрії, зокрема, для побудов за допомогою циркуля і лінійки.
Крім того, у програми багаті можливості роботи з функціями (побудова графіків, обчислення коренів, екстремумів, інтегралів і т.д.) за рахунок команд вбудованої мови (який, до речі, дозволяє управляти і геометричними побудовами).
Програма написана Маркусом Хохенвартером на мові Java (відповідно кроссплатформенная, тобто працює на великій кількості операційних систем, де є віртуальна машина java). Переведена на 39 мов. Повністю підтримує російську мову

Octave - мова високого рівня призначена для виконання обчислень чисельними методами та математичних обчислень.
Він являє собою зручний командний інтерфейс для вирішення лінійних і нелінійних математичних задач, а також проведення інших арифметичних експериментів, використовуючи мову, в більшості випадків сумісний з Matlab.

Scratch — просте, інтерактивне середовище спільної розробки програм, призначене для створення інтерактивних оповідань, анімації, ігор, музики та графіки — та публікації їх в Інтернеті. Scratch покликаний допомогти дітям (від 8 років та старше) реалізувати освітні навички XXI століття. У міру того, як вони створюють проекти Scratch, діти вивчають важливі математичні та комп'ютерні поняття, а також набувають більш глибокого розуміння процесу розробки.

BASIC-256 - це проста у використанні версія BASIC, призначена для навчання дітей основ програмування. Використовує традиційні команди, такі як gosub, for/next та goto, що спрощує для дітей розуміння ходу роботи програми. Має вбудований графічний режим, що дозволяє намалювати картинку на екрані за кілька хвилин, а також набір докладних та простих посібників, які пояснюють принципи програмування на кумедних прикладах.

GCompris - велика колекція навчальних ігор і вправ для дітей від 2 до 10 років. Деякі із завдань подано в ігровій формі, але й вони є навчальними.

Наразі GCompris містить понад 100 вправ. Ось список категорій діяльності з деякими прикладами:

Fritzing — это аппаратная инициатива, которая делает электронику доступной как творческий материал для каждого. Программный инструмент в духе Processing и Arduino позволяет документировать свои прототипы, делиться ими с другими, преподавать электронику в классе, а также компоновать и производить профессиональные печатные платы.

Scribus - додаток для професійної візуальної верстки друкованих документів (газет, журналів, брошур, літератури тощо) здатне створювати високоякісні сторінки, для будь-яких цілей - будь то тиражування для типографського друку або поширення в електронному вигляді.
Scribus підтримує всі можливості професійних видавничих систем, такі як широкі можливості по верстці і до-друкованої підготовці тексту, колірну модель CMYK, Spot Colors, систему управління виводу кольору ICC, створення PDF-файлів.
Це аналог AdobeInDesign або QuarkXPress.

Tux, of Math Command (TuxMath) є освітньої аркадной грою за участю Тукса, талісмана Linux! Заснована на сюжеті класичної аркадной гри Missile Command. Тукс повинен захищати своє місто. Однак, в даному випадку, він робить це, вирішуючи арифметичні задачі

Комп'ютерна програма, призначена для візуалізації молекул і використовувана переважно для вивчення і отримання зображень просторових структур біологічних макромолекул, в першу чергу білків і нуклеїнових кислот.
Починаючи з версій серії 2.7, RasMol поширюється по подвійний ліцензії (GPL або RASLIC). Тим самим, RasMol (поряд з Jmol і PyMOL) - одна з небагатьох програм візуалізації молекул з відкритим кодом.
RasMol залишається кращою з навчальних програм візуалізації молекул; крім того, не дивлячись на наявність більш складних аналогів, продовжує активно використовуватися молекулярними біологами та біоінформатики. Завдяки простій і логічній структурі призначеного для користувача інтерфейсу, програма проста для освоєння. Система команд ( "мова" RasMol'а) використовується в інших програмах, наприклад, в Jmol.
Вихідними даними для візуалізації служать координати атомів молекул (або комплексу молекул), що містяться в файлі формату Protein Data Bank (PDB). Файли з координатами атомів можуть бути скопійовані з одного із сайтів PDB.