Це повністю готова система візуалізації молекул (молекулярної візуалізації) для використання в структурній біології.
Дозволяє створювати високоякісні тривимірні зображення як малих молекул, так і біологічних макромолекул, насамперед білків.
Приблизно чверть усіх зображень структур білків, що публікуються в науковій літературі, зроблено за допомогою PyMOL.

оболонка для електронних словників
* Пошук за шаблоном. Можна вводити слова, що містять «*» і «?» як шаблони.
* Нечіткий запит. Можна скористатися «нечітким запитом». Він використовує алгоритм Левенштейна для підрахунку схожості двох слів, і видає слова, які найбільш підходять введеному запиту. Для використання цієї можливості запит повинен починатися з «/».
* повнотекстовий пошук призначений для пошуку слова в словнику без допомоги індексу. Більш повільний пошук, але дозволяє шукати збіги в текстах статей.
* Сканування виділеного. При виділенні слова і, залежно від налаштувань, при натисканні клавіш його переклад відображається в спливаючому вікні.
* Управління словниками. Вимкнення непотрібних словників, а також установка порядок їх використання при запиті.
* Пошук в інтернеті для різних онлайн словників.
* Вимова слів. При наявності звукових записів словник може виконувати вимову слів.
* Переклад повних текстів, використовуючи інтернет-сервіси

Інтегроване середовище розробки додатків (IDE) на мовах програмування Java, JavaFX, Ruby, Python, C ++, PHP, JavaScript / HTML5, Groovy і ряді інших. Для підтримки розробки для мобільних платформ (J2ME) необхідно встановити окремо NetBeans Mobility Pack.

За якістю і можливостям останні версії NetBeans IDE не поступаються кращим комерційним (платним) інтегрованим середах розробки для мови Java, таким, як IntelliJ IDEA, підтримуючи рефакторинг, профілювання, виділення синтаксичних конструкцій кольором, автодоповнення набираються конструкцій на літа, безліч зумовлених шаблонів коду та ін.

FlameRobin - інструмент з графічним інтерфейсом для адміністрування системи управління базами даних Firebird
Її цілі:
- невимогливість до ресурсів (мале споживання пам'яті, швидка робота)
- кроссплатформенность (Linux, Windows для початку, запланована підтримка та інших систем)
- залежність тільки від одного вільного програмного забезпечення.

SQLiteman - інструмент адміністрування баз даних sqlite3 в графічному інтерфейсі дуже простий у використанні.

Colobot (Colonize with Bots) — гра, спрямовану навчання програмування через розвагу. Ви граєте роль астронавта, мандрівного з роботами-помічниками у пошуку планети для колонізації.
Особливістю гри є 3D-графіка в реальному часі і C++ і Java-подібна об'єктно-орієнтована мова CBOT, яку можна використовувати для програмування доступних у грі роботів.

Android Studio це Інтегроване середовище розробки (Іср) для Android платформи. Грунтуючись на програмному забезпеченні JetBrains 'IntelliJ IDEA, Android Studio розробляється спеціально для розробки під Android.

Можливості:
(див. докладніше)

Valentina Studio надає можливості створення, редагування, SQL-запити, імпорт та адміністрування популярних баз даних: Valentina DB, MySQL, SQLite та Postgre SQL за допомогою наступних інструментів:
- редактор схем та діаграм
- Редактор даних
- SQL редактор
- адміністрування, діагностика, компресія, клонування, дефрагментація бази
і багато іншого.

MathMod позволяет строить трехмерные математические поверхности, описываемые неявными или параметрическими уравнениями, и предлагает очень большую базу данных образцов моделей, которые можно сгенерировать с его помощью.
Он визуализирует и анимирует неявные и параметрические поверхности.
MathMod поддерживает:
✔ 3D и 4D черчение и анимацию
✔ текстуры и пигментацию
✔ эффекты шума и турбулентности
Имеет большой набор скриптовых примеров. Формат выходного файла OBJ.

VariCAD - це 3D / 2D САПР. Має багато інструментів для 3D-моделювання та 2D-креслення.
VariCAD забезпечує підтримку параметрів і геометричних обмежень, інструменти для корпусів, трубопроводів, розрахунки, специфікації і багато іншого. Ви можете видавлювати і обертати 2D геометрію, щоб отримати тривимірні тіла. На додаток до стандартних булевих операцій об'єднання і віднімання, ви отримуєте інструмент вирізання і збереження, збереження деталі, вирізка збереженої деталі і інструменту, і додавання вирізаної частини. Коли тверді тіла побудовані, вони можуть бути проаналізовані різними способами, від відстані між об'єктами до центрів мас і моментів інерції.
Varicad може імпортувати і експортувати як DXF так і IGES.