Це повністю готова система візуалізації молекул (молекулярної візуалізації) для використання в структурній біології.
Дозволяє створювати високоякісні тривимірні зображення як малих молекул, так і біологічних макромолекул, насамперед білків.
Приблизно чверть усіх зображень структур білків, що публікуються в науковій літературі, зроблено за допомогою PyMOL.

ParaView - програма для паралельної інтерактивної наукової візуалізації, має клієнт-серверну архітектуру для полегшення віддаленої візуалізації баз даних і генерування моделей рівнів деталізації (level of detail - LOD). Варто відзначити, що дана програма заснована на бібліотеці VTK (Visualization Toolkit), яка надає візуалізаційні сервіси для різних видів паралельної обробки даних, тому ParaView може бути запущена на кластерах і комп'ютерах із загальною або розподіленої пам'яттю.

За допомогою FlashQuard ви можете створювати картки для повторення будь-якого матеріалу. Додаток дозволяє створювати картки для різних тем, вставляти картинки, записувати відповіді, крім того, воно включає функцію "електронної озвучення".

зображення точного графічного моделювання нічного неба, з будь-якого місця на Землі, на будь-яку дату і час. Дисплей включає 130000 зірок, 13000 об'єктів глибокого космосу, всі 8 планет, Сонця і Місяця, і тисячі комет і астероїдів. він включає в себе інструменти для астрономічних обчислень і може контролювати телескопи і камер.

GeoGebra - вільно-розповсюджувана (GPL) динамічна геометрична середовище, яке дає можливість створювати креслення в планіметрії, зокрема, для побудов за допомогою циркуля і лінійки.
Крім того, у програми багаті можливості роботи з функціями (побудова графіків, обчислення коренів, екстремумів, інтегралів і т.д.) за рахунок команд вбудованої мови (який, до речі, дозволяє управляти і геометричними побудовами).
Програма написана Маркусом Хохенвартером на мові Java (відповідно кроссплатформенная, тобто працює на великій кількості операційних систем, де є віртуальна машина java). Переведена на 39 мов. Повністю підтримує російську мову

Деякі з очікуваних можливостей:
Малювання (повузлове малювання; шаблони для поширених кілець; розширення загальних груп; малювання радикалів, зарядів, стрілок; підтримка кольору ...)
Редагування (необмежені можливості відміни і затримки; вирівнювання; масштабування; обертання (2D і 3D) ...)
експорт і імпорт (повністю підтримується експорт в формати SVG, OpenOffice.Org-Draw, EPS; базова підтримка імпорту та експорту CML1 і CML2).

Гра являє собою графічний анімаційний редактор, який дозволяє просто і наочно (у вигляді анімації) змоделювати і показати різні фізичні процеси. Об'єкти можна створювати в процесі "на льоту" і вони відразу починають підкорятися законам фізики.
Наприклад, за допомогою всього лише кількох кліків миші можна сконструювати машинку і поставити на неї "моторчик". Потім натиснути "Play" і насолоджуватися рухом

KWordQuiz є спільною програмою флеш мети, що часто використовується для словника навчання. KWordQuiz може відкрити словник даних в різних форматах, в тому числі kvtml формат, який використовується в KDE програм, таких як Парлі, WQL формат, який використовується WordQuiz для Windows, xml.gz формат, який використовується Паукер, і CSV текст.

Освітнє програмне забезпечення, покликане зробити вивчення програмування простим та захоплюючим.

Greenfoot - це інтегроване середовище розробки з використанням Java або Stride, призначене в першу чергу для освітніх цілей на рівні середньої школи та бакалаврату. Це дозволяє легко розробляти двовимірні графічні програми, такі як симулятори та інтерактивні ігри.

програма для візуалізації та роботи з багатовимірними поверхнями, які визначаються математичними рівняннями. Так само може застосовуватися як редактор моделей для POV-Ray в області параметричних поверхонь.