Vym (View Your Mind) – це програма для створення діаграм зв'язків. Вона корисна для організації думок та роботи зі структурування чогось.
Діаграма зв'язку (інтелект-карта, mindmap) - це кольорова радіальна діаграма із зображенням у центрі, що ілюструє семантичні та інші зв'язки між частинами наукового матеріалу.
Наприклад, вона може графічно ілюструвати структуру плану дисертації, план проєкту чи структуру державних інституцій області.
Діаграми зв'язку мають безліч додатків у особистих, сімейних, освітніх та комерційних ситуаціях.
Можливості включають конспектування, мозковий штурм, підбивання підсумків, перегляд і загальне уточнення думок.

Chemtool - 2D-редактор для малювання хімічних сполук під X11 (використовується GTK +). Він підтримує багато стилів з'єднання, більшу частину видів відображення тексту, що використовуються в хімії і сплайнові / дугові / криві стрілки.
Малюнки можна експортувати у формати MOL і PDB, для подальшого опису - в SVG або XFig, у вигляді малюнків PiCTeX, в растрові або Postscript файли (для деяких операцій використовується програма з XFig - transfig).
Також пакет містить допоміжну програму, cht, для обчислення формул і (точного) молекулярної ваги намальованого елемента файлу chemtool. Cht може викликатися прямо з Chemtool або з консолі.

Комп'ютерна програма, призначена для візуалізації молекул і використовувана переважно для вивчення і отримання зображень просторових структур біологічних макромолекул, в першу чергу білків і нуклеїнових кислот.
Починаючи з версій серії 2.7, RasMol поширюється по подвійний ліцензії (GPL або RASLIC). Тим самим, RasMol (поряд з Jmol і PyMOL) - одна з небагатьох програм візуалізації молекул з відкритим кодом.
RasMol залишається кращою з навчальних програм візуалізації молекул; крім того, не дивлячись на наявність більш складних аналогів, продовжує активно використовуватися молекулярними біологами та біоінформатики. Завдяки простій і логічній структурі призначеного для користувача інтерфейсу, програма проста для освоєння. Система команд ( "мова" RasMol'а) використовується в інших програмах, наприклад, в Jmol.
Вихідними даними для візуалізації служать координати атомів молекул (або комплексу молекул), що містяться в файлі формату Protein Data Bank (PDB). Файли з координатами атомів можуть бути скопійовані з одного із сайтів PDB.

GNS3 (graphical network simulator) - потужний симулятор, що дозволяє емулювати мережі великого розміру. Корисний адміністраторам і інженерам, а також користувачам, які готуються до здачі сертифікатів Cisco (CCNA, CCNP, CCIP, CCIE) і Juniper Networks (JNCIA, JNCIS, JNCIE). Крім образів Cisco IOS, GNS3 вміє працювати з olive образами JunOS.
Можлива емуляція простих Ethernet, ATM і Frame Relay світчей і фаєрів (ASA, PIX). Дозволяє підключити віртуальний світч до мережевої карти реальної або віртуальної системи. Всі настройки проводяться в інтуїтивно зрозумілій графічному середовищі.

Система комп'ютерної алгебри Maxima - має найширший набір засобів для проведення аналітичних обчислень, чисельних обчислень і побудови графіків.
По набору можливостей система близька до таких комерційних систем як Maple і Mathematica.
Це єдина з існуючих систем аналітичних обчислень, яка може працювати на всіх основних сучасних операційних системах на комп'ютерах, починаючи від найпотужніших аж до наладонних комп'ютерів.

Oregano - являє собою додаток для схематичного захоплення і моделювання електронних схем.
Він може відкривати і редагувати схеми, які створені з використанням Gnucap, NG-Spice або Berkeley spice

Графічне середовище для візуалізації масивів даних на основі бібліотеки MathGL, дозволяє легко переглядати, маніпулювати і будувати набори даних і формул.
А також:
✔широкий спектр графічних ефектів з простою мовою сценаріїв MGL;
✔ поворот, масштабування і GIF-анімація;
✔подтримка згладжування освітлення, прозорості, довільних криволінійних координат, TeX-символів і формул;
✔таблиці для редагування даних з підтримкою 3-мірних масивів;
✔набір для обробки даних (згладжування, зміна розмірів, кадрування та ін.);
✔експорт в растрові і векторні формати (PNG, JPEG, EPS або SVG).

Эта программа представляет собой реализацию оригинальных счетов, она предоставляет китайскую, японскую, корейскую, римскую и русскую версии и может быть изменена для использования другими.

Програма для створення двовимірних малюнків молекул. Вона схожа за функціональністю на інші графічні програми, наприклад, ChemDraw.
Вона може читати і писати різні формати текстових і бінарних файлів, дає змогу обмінюватися інформацією між XDrawChem і іншими програмними додатками, а також може створювати зображення в популярних графічних форматах, таких як PNG і EPS.

проста у використанні математична програма загального призначення, здатна вирішувати, спрощувати, комбінувати, диференціювати, порівнювати алгебраїчні рівняння. Дозволяє робити операції зі звичайними і комплексними числами, а також працювати з многочленами.