CodeLite – це потужна та легка IDE, що спеціалізується на C, C++, PHP та Javascript.

Її особливості включають:
* Загальна підтримка компіляторів.
* Вбудована підтримка GDB.
* Механізм завершення коду на основі бази даних.
* Підсвічування синтаксису для файлів C/C++, Java, Perl, XML, Makefile, Lua, Diff, PHP, JavaScript, Python, HTML та ASP
* Складання тексту
* генератор коментарів doxygen.

Veusz – це пакет для створення 2D та 3D наукових графіків, призначений для створення готових до публікації PDF, SVG, Postscript та растрових зображень.
Veusz надає графічний інтерфейс, командний рядок та інтерфейс сценаріїв (на основі Python) для своїх засобів побудови графіків.
Графіки будуються з використанням об'єктно-орієнтованої системи, що забезпечує одноманітний інтерфейс.

Середовище розробки з упором на продуктивність розробника. IntelliJ IDEA глибоко аналізує код і надає набір потужних утиліт без нав'язування певного робочого простору або структури проекту.
IntelliJ IDEA - це ваш ідеальний напарник-програміст, що розбирається в коді і дає вдалі пропозиції тоді, коли ви цього потребуєте, і завжди готовий допомогти вам обробити код.

BASIC-256 - це проста у використанні версія BASIC, призначена для навчання дітей основ програмування. Використовує традиційні команди, такі як gosub, for/next та goto, що спрощує для дітей розуміння ходу роботи програми. Має вбудований графічний режим, що дозволяє намалювати картинку на екрані за кілька хвилин, а також набір докладних та простих посібників, які пояснюють принципи програмування на кумедних прикладах.

Cycas повний 2D +3 D CAD пакет для X11. Деякі з його особливостей: Простота у використанні GTK + інтерфейс, WYSIWYG дисплей, друку, креслення, фільтрів імпорту / експорту, фотореалістичної візуалізації, спеціальні методи для архітектурного проектування, повний HTML документацію, навчальні посібники, наприклад малюнків, шрифтів і символів.

Colobot (Colonize with Bots) — гра, спрямовану навчання програмування через розвагу. Ви граєте роль астронавта, мандрівного з роботами-помічниками у пошуку планети для колонізації.
Особливістю гри є 3D-графіка в реальному часі і C++ і Java-подібна об'єктно-орієнтована мова CBOT, яку можна використовувати для програмування доступних у грі роботів.

Thonny — це проста IDE Python із функціями, корисними для навчання програмуванню.

Він постачається з налагоджувачем, який здатний візуалізувати всі концептуальні кроки, зроблені для запуску програми Python (виконання операторів, оцінка виразів, підтримка стека викликів). Існує графічний інтерфейс для встановлення пакетів сторонніх розробників і спеціальний режим для вивчення посилань.

Даний продукт багато в чому є аналогом (а подекуди і набагато більш функціональний) комерційного пакету Vector NTI, однак відрізняється кроссплатформенную, підтримкою можливостей сучасного заліза (многопоточность, CUDA) і можливістю самому писати плагіни або мишеклікабельно створювати обчислювальні ланцюжки з плагінів вже існуючих.

Основні можливості:
- Множина вирівнювання послідовностей на основі MUSCLE 3 і MUSCLE 4;
- Аналіз за допомогою прихованих марківських моделей, заснований на HMMER 2 і HMMER 3;
- Дизайн ПЛР-праймерів за допомогою Primer 3;
- Передбачення вторинної структури білків за допомогою GOR IV і PSIPRED;
- Філогенетичний аналіз за допомогою Phylip;
- Пошук сайтів рестрикції;
- Супершвидкий пошук простих і тандемних повторів;
- Аналіз сайтів зв'язування транскрипційних факторів на основі SITECON;
- Пошук відкритих рамок зчитування;
- Вирівнювання послідовностей за допомогою алгоритму з мита-Ватермана.

iTest це програма, яка дозволяє вам скористатися перевагами комп'ютеризованого іспиту.
iTest складається з двох програм:
- iTestServer - питання / відповідь редактора бази даних і сервера іспит
- iTestClient - тестовий клієнт використовується студентами, підключається до сервера
iTest дозволяє легко створити базу даних питань і відповідей і провести тестування.

Це повністю готова система візуалізації молекул (молекулярної візуалізації) для використання в структурній біології.
Дозволяє створювати високоякісні тривимірні зображення як малих молекул, так і біологічних макромолекул, насамперед білків.
Приблизно чверть усіх зображень структур білків, що публікуються в науковій літературі, зроблено за допомогою PyMOL.