Даний продукт багато в чому є аналогом (а подекуди і набагато більш функціональний) комерційного пакету Vector NTI, однак відрізняється кроссплатформенную, підтримкою можливостей сучасного заліза (многопоточность, CUDA) і можливістю самому писати плагіни або мишеклікабельно створювати обчислювальні ланцюжки з плагінів вже існуючих.

Основні можливості:
- Множина вирівнювання послідовностей на основі MUSCLE 3 і MUSCLE 4;
- Аналіз за допомогою прихованих марківських моделей, заснований на HMMER 2 і HMMER 3;
- Дизайн ПЛР-праймерів за допомогою Primer 3;
- Передбачення вторинної структури білків за допомогою GOR IV і PSIPRED;
- Філогенетичний аналіз за допомогою Phylip;
- Пошук сайтів рестрикції;
- Супершвидкий пошук простих і тандемних повторів;
- Аналіз сайтів зв'язування транскрипційних факторів на основі SITECON;
- Пошук відкритих рамок зчитування;
- Вирівнювання послідовностей за допомогою алгоритму з мита-Ватермана.

Програма для нелінійної апроксимації і аналізу функцій. Дозволяє проводити візуалізацію даних, а основне її призначення - поділ перекриваючих піків, і підбір параметрів методом найменших квадратів з використанням стандартного алгоритму Левенберга-Марквардта, звичайного алгоритму або сімлексного методу Нелдера-Міда.
За замовчуванням у програмі є вбудовані загальні «дзвоновидні »(bell-shaped) функції (Gaussian, Loretzian, Pearson 7, Voigt, Pseudo-Voigt) і поліноми. Будь-які ж призначені для користувача функції можуть бути легко додані. Підтримують також фонову заміну змінних, калібрування даних і автоматизацію завдань за допомогою простої скриптової мови програмування.

gBrainy - логічна гра, що розвиває пам'ять, логіку, мислення, уважність і кмітливість. Містить 4 види ігор: логічні, математичні, на тренування пам'яті та на знання сенсу і природи слів. Має 3 рівня складності. Розширюється різними головоломками і завданнями за допомогою доповнень.

Quantum GIS (QGIS) є географічною інформаційною системою (ГІС) з дружнім інтерфейсом і відкритим вихідним кодом. QGIS поширюється на умовах ліцензії GNU General Public License і працює в Linux, Unix, Mac OSX і Windows.
QGIS підтримує векторні і растрові формати (в тому числі широко поширені ESRI Shapefile і GeoTIFF), а також просторові бази даних. Для QGIS існує безліч всіляких плагінів, управління якими здійснюється за допомогою Менеджера плагінів.

Scratch — просте, інтерактивне середовище спільної розробки програм, призначене для створення інтерактивних оповідань, анімації, ігор, музики та графіки — та публікації їх в Інтернеті. Scratch покликаний допомогти дітям (від 8 років та старше) реалізувати освітні навички XXI століття. У міру того, як вони створюють проекти Scratch, діти вивчають важливі математичні та комп'ютерні поняття, а також набувають більш глибокого розуміння процесу розробки.

OpenWebStart – сучасна заміна застарілої технології Java Web Start та стандарту JNLP (Java Network Launch Protocol).

Надає найчастіше використовувані функції Java Web Start та стандарту JNLP, що дозволяє продовжувати використовувати та запускати Java-додатки, які раніше працювали через Java Web Start, без необхідності переписувати код.

Можливості:

Anjuta - це гнучке інтегроване середовище розробки (Integrated Development Environment - IDE) для мов C і C ++, яка включає ряд потужних засобів для програмування. Серед них - засоби управління проектом, майстри додатків, вбудований інтерактивний відладчик, потужний редактор вихідного коду із засобами перегляду і підсвічуванням синтаксису.

Viking создан быть простым в использовании, но достаточно мощным для решения широкого спектра задач связанных с GPS. Он использует иерархическую систему слоев для организации данных GPS, карт и других типов слоев с пространственными данными, такими как координатные линии.

САПР німецьких розробників, активно розвивається, можливо безкоштовне використання без обмежень.

gCAD3D може:
- імпорт і експорт-програм (STEP, IGES, VRML, DXF, SVG ..)
- інтегрований 3D-OpenGL глядача,
- програма перекладач для геометрії і NC команди в 3D,
- інтегрованих НК процесора.
- інтерфейс програмування для userprograms (плагінів)

Tux, of Math Command (TuxMath) є освітньої аркадной грою за участю Тукса, талісмана Linux! Заснована на сюжеті класичної аркадной гри Missile Command. Тукс повинен захищати своє місто. Однак, в даному випадку, він робить це, вирішуючи арифметичні задачі